Na Ilha dos Lençóis a flora é composta de Mangue Vermelho, (a espécie dominante), de Mangue Branco e de Mangue Siriba ou Siriúba. As restingas, formações vegetais que cobrem as areias constituem uma paisagem restrita, comparada aos manguezais. Dois outros atrativos de destaque são suas praias, algumas com quilômetros de extensão em estado selvagem, e o extraordinário campo de dunas de areia muito fina e inacreditavelmente branca, pipocadas por lagoas temporárias de água da chuva.

O lugar também é um verdadeiro santuário para as aves que vivem parte de sua vida entre eles, principalmente as migratórias como o maçarico que encontram nas praias desertas a proteção para descansar e se reproduzir. Os guarás, garças, falcões, biguás, jaçanã, e outros, se alimentam basicamente de peixes, crustáceos e moluscos. Entre os mamíferos, o Coati e o Guaxinim são especialistas em alimentar-se de caranguejos.